Do đó, TS. Nguyễn Minh Nam (Trường Y, ĐHQG TPHCM) và cộng sự đã thực hiện một nghiên cứu để tìm hiểu về các đặc trưng kiểu gene của các chủng virus FMDV trên bảy mẫu đã được thu thập. Sau khi phân lập virus, các nhà nghiên cứu đã giải trình tự gene để phân tích và so sánh với trình tự gene tham chiếu ở GenBank. Phân tích kiểu hình di truyền cho thấy cả bảy mẫu đều thuộc về kiểu huyết thanh O, kiểu topo SEA/Mya-98. Các chủng này đều có sự tương đồng cao với các chủng khác ở Việt Nam (2018), Hàn Quốc, Trung Quốc nhưng lại ít tương đồng với chủng sử dụng trong vaccinec. Tuy nhiên, 21 amino acid thay thế có trong protein VP1 của các chủng FMDV thực địa, nhiều amino acid trong đó là yếu tố quyết định kháng nguyên tham gia vào vô hiệu hóa virus FMDV. Các phát hiện cho thấy vaccine hiện hành không hiệu quả chống lại các chủng FMDV mới xuất hiện ở miền Nam.